Faisant suite aux protestations des riverains en 2005, un programme d’aménagement complémentaire fut proposé par Réseau Ferré de France (RFF) en vue d’apporter une meilleure protection aux populations concernées.
Tandis qu’un compromis se dégageait dès 2006 pour le secteur Est, aucune solution d’aménagement satisfaisant les demandes des riverains n’a été trouvée à l’Ouest.
Au vu de cette situation, l’Etat, la Région Ile de France et Réseau Ferré de France (RFF) ont élaboré un accord tripartite désigné "Protocole relatif aux modalités de réalisation de l’aménagement ferroviaire entre Massy et Valenton". La Région Ile de France et Réseau Ferré de France (RFF) ont signé le protocole en 2008 et l’Etat, dernier signataire, en 2009.
Le protocole détermine les conditions à la poursuite du projet :
Les études complémentaires devront permettre de déterminer le gain possible en régularité et en performance en suivant la démarche de phasage du protocole.
Ce protocole scinde l'opération Massy-Valenton en 2 phases :
Phase 1 : le secteur Est dont le calendrier prévisionnel est le suivant :
Phase 2 : le secteur Ouest dont un premier projet a été présenté suite aux études menées par RFF. Ce projet initial permet d’éviter les cisaillements des voies du RER C par les TGV et donc d’éviter les "nez-à-nez" TGV-RER, par un passage "en terrier" sous les lignes du RER C. Il prévoit également de dédoubler en sortie de la gare de Massy les voies de TGV pour éviter le "nez-à-nez" TGV-TGV sur la partie qui rejoint la ligne Massy-Valenton.
Ce dédoublement nécessite un ripage des voies des lignes des RER C et B vers le Nord en élargissant les emprises au sol de la plate-forme ferroviaire.
Suite aux blocages du projet initial, Réseau Ferré de France réétudie le projet, avec l’ambition de trouver une solution qui ne nécessite pas l’élargissement des emprises au sol de la plate-forme ferroviaire, tout en gardant l’objectif d’accroître la fréquence du RER C à 4 trains par heure (au lieu de 2 actuellement). Par ailleurs, Réseau Ferré de France (RFF) proposera la suppression du passage à niveau de la rue Mirabeau (commune d’Antony), ainsi que la création de protections acoustiques.
Compte-tenu de ces évolutions proposées au projet initial, le maire d’Antony a donné son accord sur une telle démarche lors de sa rencontre du 24 septembre 2009 avec le directeur régional Ile de France de RFF. Des études d’analyse de l’impact sonore du projet et des mesures de protections acoustiques à envisager viennent d’être lancées.
Des études complémentaires, financées par l’Etat et Réseau Ferré de France (RFF), sont nécessaires pour s’assurer que :